Formado en los Conservatorios de Valencia, Madrid y Héctor Berlióz de París, Juan Carlos Chornet inició una intensa carrera musical en el año 1990 que le ha llevado por escenarios de toda Europa.
Como solista o junto a formaciones de cámara ha sido dirigido por algunos de los más prestigiosos directores del momento, como Christopher Hogwood, Frans Brüggen, George Benjamín, Josep Pons, Fabio Biondi, Rinaldo Alessandrini, Harry Christopher Lorin Maazel… actuando junto solistas como Marta Almajano, Victoria De Los Ángeles, Jana Bouskova, Vitoria Mullova, Placido Domingo entre otros.
Desde 1991 es flauta solista de la Orquesta Ciudad de Granada ciudad donde reside. Labor que compagina con la de profesor de flauta en la Escuela Superior de Música de Alto Rendimiento (Esmar) de Valencia. Junto a la Orquesta Ciudad de Granada ha participado en todas sus grabaciones y giras internacionales (Alemania, Austria, Italia, Gran Bretaña, Bélgica y Portugal). Juan Carlos Chornet ha actuado, asimismo, junto a muchas de las principales orquestas del país, Orquesta de Valencia, Orquesta Sinfónica de Barcelona y Nacional de Cataluña, Orquesta Filarmónica de Gran Canaria, Real Orquesta Sinfónica de Sevilla, Orquesta de cámara Teatre Lliure, etc. en escenarios, ciclos y festivales de Granada (Festival I. de Música y Danza), Festival de Música de Úbeda, Festivales de Santander y San Sebastián, Festival de Música Contemporánea de Alicante, Auditorio Nacional de Madrid, Teatro de la Maestranza de Sevilla, Palau de la Música de Valencia, Palau de la Música Catalana, Auditorios de Zaragoza, Tenerife,etc. Formó parte de la Orquesta que se creó para la inauguración de El Palau de les Arts de Valencia.
Es miembro fundador del ensemble Neo Ars. Este grupo nació en 2008 a partir de la experiencia de sus miembros en la interpretación y composición de la música contemporánea y su objetivo fundamental es apoyar y fomentar la excelencia en esos ámbitos. Desde su creación el grupo realiza una intensa actividad dentro y fuera de nuestras fronteras, ofreciendo recitales en destacados eventos y espacios: Ciclos series20/21 del CNDM, Jornadas de música contemporánea de Málaga, congreso en España de la European festivals association, centro Blumental de Tel Aviv centro Cerise de Paris, Festival de Música Contemporánea de Tenerife, teatro Central de Sevilla o Teatro Alhambra de Granada entre otros.